Laboratorium Simulasi Politeknik Kelautan dan Perikanan Kupang berperan penting dalam meningkatkan pengetahuan serta komptensi taruna program studi Penangkapan Ikan dalam bernavigasi. Kemampuan navigasi mutlak untuk dikuasai oleh taruna program studi Teknik Penangkapan Ikan yang nantinya dapat menjadi perwira maupun awak kalap perikanan yang cakap dan tangguh.  Untuk mewujudkan tujuan tersebut, Laboratorium navigasi sudah memiliki berbagai fasilitas alat-alat navigasi yang cukup lengkap. Baik alat navigasi tradisional maupun alat navigasi modern.  Data Inventaris Ruangan Laboratorium Navigasi tercatat dalam BMN